grain_iconCMap Home | Maps | Map Search | Feature Search | Matrix | Map Sets | Feature Types | Map Types | Evidence Types | Species | Saved Links | Help | Tutorial  

Welcome to the Matrix

Each cell in the matrix shows the number of correspondences between apair of maps. A correspondence is any relationship between two features.

Restrict Reference Sets By:         Use Colors Hide Empty Rows
Reference Set QTL Reference Set
Oryza sativa
  Aberdeen Bala/Azu QTL 2002  
   
Sequence Brachypodium distachyon Brachypodium distachyon 1.0 3(2) Brachypodium distachyon 1.0 Brachypodium distachyon Sequence
Oryza sativa Gramene IRGSP Assm 2005 1,571(25) Gramene IRGSP Assm 2005 Oryza sativa
Class I SSR (93-11) 2005 100(5) Class I SSR (93-11) 2005
Class I SSR (IRGSP) 2005 100(5) Class I SSR (IRGSP) 2005
Class I SSR (TIGR) 2005 100(5) Class I SSR (TIGR) 2005
Oryza sativa indica BGI 93-11 Sequence 2005 45(4) BGI 93-11 Sequence 2005 Oryza sativa indica
Oryza sativa japonica Gramene Annotated Nipponbare Sequence 2009 7,185(52) Gramene Annotated Nipponbare Sequence 2009 Oryza sativa japonica
IARI Nipponbare SSR 2009 - IARI Nipponbare SSR 2009
Sorghum Sorghum bicolor JGI8X 2007 50(30) Sorghum bicolor JGI8X 2007 Sorghum
Physical Wheat IWGSC Physical 3B - IWGSC Physical 3B Wheat Physical
Bin Maize Bins 31(22) Bins Maize Bin
Cytogenetic Maize CMM Cytogenetic FISH 2007 - CMM Cytogenetic FISH 2007 Maize Cytogenetic
Deletion Wheat wEST 2003 1(1) wEST 2003 Wheat Deletion
Genetic Aegilops tauschii Dvorak 2009 - Dvorak 2009 Aegilops tauschii Genetic
Barley Barley consensus - 1995 - Barley consensus - 1995 Barley
Barley consensus 2 - 1996 - Barley consensus 2 - 1996
Barley consensus 2003 - Barley consensus 2003
Barley genes 2 - 1997 - Barley genes 2 - 1997
Close 2943-SNP 2009 - Close 2943-SNP 2009
NABGMP SxM 1993 - NABGMP SxM 1993
Barley, Consensus 2006, Stein - Barley, Consensus 2006, Stein
Foxtail millet Devos 2011 2(2) Devos 2011 Foxtail millet
Maize BNL 1996 7(1) BNL 1996 Maize
Cornell Wilson 1999 84(9) Cornell Wilson 1999
IBM 2002 43(7) IBM 2002
IBM2 2008 Neighbors 32(22) IBM2 2008 Neighbors
Nested Association Mapping (NAM) 2008 - Nested Association Mapping (NAM) 2008
SSR IBM 2001 23(3) SSR IBM 2001
UMC 1998 343(18) UMC 1998
Oat Cornell Diploid 1995 25(5) Cornell Diploid 1995 Oat
Oat, KxO, 2003 - Oat, KxO, 2003
Oryza sativa CIAT SSR 2006 59(4) CIAT SSR 2006 Oryza sativa
Cornell SSR 2001 251(13) Cornell SSR 2001
IGCN 1998 618(24) IGCN 1998
IRMI 2003 86(6) IRMI 2003
JRGP RFLP 2000 723(23) JRGP RFLP 2000
KRGRP 1998 390(18) KRGRP 1998
Hokkaido Morphological 2000 - Hokkaido Morphological 2000
Niigata RFLP 2000 159(12) Niigata RFLP 2000
TTU CTIR 2000 236(13) TTU CTIR 2000
TTU IRIR 2000 125(7) TTU IRIR 2000
Oryza sativa x Oryza eichingeri IGCN sativa/eichingeri RFLP 288(17) IGCN sativa/eichingeri RFLP Oryza sativa x Oryza eichingeri
Oryza sativa x Oryza longistaminata Cornell RFLP 1994 298(16) Cornell RFLP 1994 Oryza sativa x Oryza longistaminata
Cornell RFLP 2001 491(19) Cornell RFLP 2001
Oryza sativa x Oryza rufipogon Huazhong RFLP 1997 388(17) Huazhong RFLP 1997 Oryza sativa x Oryza rufipogon
Pearl Millet JIC 81B/ICMP 2004 38(4) JIC 81B/ICMP 2004 Pearl Millet
JIC ICMB/863B 2004 - JIC ICMB/863B 2004
JIC LGD1/ICMP 2004 113(5) JIC LGD1/ICMP 2004
JIC PT732B/P1449 2004 - JIC PT732B/P1449 2004
Rye Rye, Ds2 x RxL10 1993 - Rye, Ds2 x RxL10 1993 Rye
Sorghum Klein 2004 13(2) Klein 2004 Sorghum
Mace 2009 3(1) Mace 2009
Paterson 2003 202(16) Paterson 2003
Switchgrass Okada 2010 - Okada 2010 Switchgrass
Wheat Composite 2004 17(3) Composite 2004 Wheat
Consensus SSR 2004 - Consensus SSR 2004
Cornell Synthetic/Opata 1995 32(4) Cornell Synthetic/Opata 1995
Wheat genes - 1993 - Wheat genes - 1993
QTL Barley Apex/H. spontaneum BC SSR QTL 2003 - Apex/H. spontaneum BC SSR QTL 2003 Barley QTL
Galleon/Haruna nijo RFLP/AFLP/SSR QTL 2003 - Galleon/Haruna nijo RFLP/AFLP/SSR QTL 2003
JIC Igr/Tri QTL 1995 - JIC Igr/Tri QTL 1995
NCSL Zhed/ND//Fos QTL 2003 - NCSL Zhed/ND//Fos QTL 2003
OSU Har/Mor QTL 2000 - OSU Har/Mor QTL 2000
Steptoe/Morex DH RFLP QTL 2006 - Steptoe/Morex DH RFLP QTL 2006
Tadmor/Er Apm RI RFLP/AFLP/SSR QTL 1998 - Tadmor/Er Apm RI RFLP/AFLP/SSR QTL 1998
UMN Fred/Stan QTL 2003 4(1) UMN Fred/Stan QTL 2003
Foxtail millet UM B100/A10 QTL 2004 87(7) UM B100/A10 QTL 2004 Foxtail millet
Maize Bologna Os420/Iab78 QTL 1998 - Bologna Os420/Iab78 QTL 1998 Maize
CIMMYT Ac7729/Ac7643S QTL 1996 - CIMMYT Ac7729/Ac7643S QTL 1996
INRA Io/F2 Composite QTL 1996 - INRA Io/F2 Composite QTL 1996
Iowa Mo17/H99 RI QTL 1996 - Iowa Mo17/H99 RI QTL 1996
MISCU H123/AG19 BC1 QTL 2003 - MISCU H123/AG19 BC1 QTL 2003
Maize Bins QTL 2005 28(21) Maize Bins QTL 2005
NCSU B73/Mo17 QTL 1992 - NCSU B73/Mo17 QTL 1992
UWM B73/Mo17 RFLP SSR QTL 1996 - UWM B73/Mo17 RFLP SSR QTL 1996
Oat Cornell Kan/Ogl QTL 1995 - Cornell Kan/Ogl QTL 1995 Oat
Oryza sativa AGEBC KDM105/CT999 RI QTL 2000 332(22) AGEBC KDM105/CT999 RI QTL 2000 Oryza sativa
Aberdeen Bala/Azu QTL 2002 - Aberdeen Bala/Azu QTL 2002
Brazil BG90-2/RS16 QTL 2002 75(4) Brazil BG90-2/RS16 QTL 2002
CAU IRAT109/YUEFU QTL 2004 156(12) CAU IRAT109/YUEFU QTL 2004
CIRAD IR64/Azu DH QTL 2003 327(14) CIRAD IR64/Azu DH QTL 2003
CNCAU Orufi/Gui2 BC1 QTL 2001 136(10) CNCAU Orufi/Gui2 BC1 QTL 2001
CNHAU Zhenshan 97/IRAT109 SSR QTL 2006 34(3) CNHAU Zhenshan 97/IRAT109 SSR QTL 2006
CNHAU Zhen97/ H94 QTL 2005 55(4) CNHAU Zhen97/ H94 QTL 2005
CNHZAU 3037/2428 BC1F1QTL 1997 12(3) CNHZAU 3037/2428 BC1F1QTL 1997
CNHZAU 3037/2428 F2 QTL 1997 11(3) CNHZAU 3037/2428 F2 QTL 1997
CNHZAU 58S/1514 F2 QTL 1999 4(1) CNHZAU 58S/1514 F2 QTL 1999
CNHZAU Bal/Dul//Naj11 QTL 1998 61(4) CNHZAU Bal/Dul//Naj11 QTL 1998
CNHZAU Pei/8902 QTL 1999 126(9) CNHZAU Pei/8902 QTL 1999
CNHZAU Zh97/Ming63 RI QTL 2002 772(15) CNHZAU Zh97/Ming63 RI QTL 2002
CNHZAU Zhe97/Wuy2 QTL 2004 37(3) CNHZAU Zhe97/Wuy2 QTL 2004
CNNAU IR50/Tatsumimochi/Miyukimochi SSR QTL 2006 23(3) CNNAU IR50/Tatsumimochi/Miyukimochi SSR QTL 2006
CNNJAU Tai65/Bhad QTL 2002 92(6) CNNJAU Tai65/Bhad QTL 2002
CNRRI Tes/CB QTL 1997 277(11) CNRRI Tes/CB QTL 1997
CNRRI Tes/CB QTL 1998 109(10) CNRRI Tes/CB QTL 1998
CNRRI Wai/CB QTL 1996 218(11) CNRRI Wai/CB QTL 1996
CNRRI XeiB/Mil46 RI QTL 2002 98(9) CNRRI XeiB/Mil46 RI QTL 2002
CNRRI Zh97B/Mil46 RI QTL 2002 231(13) CNRRI Zh97B/Mil46 RI QTL 2002
CNSIPPE Non/Kos QTL 2004 259(13) CNSIPPE Non/Kos QTL 2004
CNWHU B5/Min63 QTL 2004 22(2) CNWHU B5/Min63 QTL 2004
CNYU Bal/Nan//Bal BC1 QTL 2001 51(4) CNYU Bal/Nan//Bal BC1 QTL 2001
CNYU Naj11/Bal DH QTL 1999 223(11) CNYU Naj11/Bal DH QTL 1999
CNZU IR1552/Azu RI QTL 2003 252(12) CNZU IR1552/Azu RI QTL 2003
CNZU IR1552/Azu RI QTL 2004 197(11) CNZU IR1552/Azu RI QTL 2004
CNZU IR20/IR55178 RI QTL 1998 9(2) CNZU IR20/IR55178 RI QTL 1998
CTIR CT9993/IR6226 QTL 2000 297(13) CTIR CT9993/IR6226 QTL 2000
Cornell 9024/LH422 RI QTL 1996 158(10) Cornell 9024/LH422 RI QTL 1996
Cornell IR64/Azu DH QTL 2001 341(14) Cornell IR64/Azu DH QTL 2001
Cornell IR64/IRG105 QTL 2003 126(6) Cornell IR64/IRG105 QTL 2003
Cornell Jef/Oruf BC QTL 2003 132(6) Cornell Jef/Oruf BC QTL 2003
Cornell V20A/Oruf QTL 1998 116(11) Cornell V20A/Oruf QTL 1998
Cornell V20A/glab QTL 2004 102(8) Cornell V20A/glab QTL 2004
FAUF Gui630/Twj DH QTL 2001 203(15) FAUF Gui630/Twj DH QTL 2001
HNAES MIL23/Aki RI QTL 2001 - HNAES MIL23/Aki RI QTL 2001
IGCAS Jas85/Lem F2 QTL 2000 245(7) IGCAS Jas85/Lem F2 QTL 2000
IGCAS ZYQ8/JX17 DH QTL 2000 218(8) IGCAS ZYQ8/JX17 DH QTL 2000
IGCAS ZYQ8/JX17 F2 QTL 1995 83(6) IGCAS ZYQ8/JX17 F2 QTL 1995
IGCN ZYQ18/JX17 DH QTL 1998 760(24) IGCN ZYQ18/JX17 DH QTL 1998
IGCN ZYQ8/JX17 RI QTL 2001 457(14) IGCN ZYQ8/JX17 RI QTL 2001
INDIR IR58025/O. rufipogon BC SSR QTL 2005 73(2) INDIR IR58025/O. rufipogon BC SSR QTL 2005
IRRI IR622/IR600 QTL 2003 170(10) IRRI IR622/IR600 QTL 2003
IRRI IR64/Azu DH QTL 2003 614(10) IRRI IR64/Azu DH QTL 2003
IRRI IR74/Jalmagna RI AFLP/RFLP QTL 2001 104(5) IRRI IR74/Jalmagna RI AFLP/RFLP QTL 2001
IRRI Lem/Teq RI QTL 2001 910(20) IRRI Lem/Teq RI QTL 2001
IRRI Mil23/Aki RI QTL 2003 372(17) IRRI Mil23/Aki RI QTL 2003
IRRI Mor/CO39 QTL 1994 246(8) IRRI Mor/CO39 QTL 1994
IRRI Pal/IR42 F2 QTL 1995 181(8) IRRI Pal/IR42 F2 QTL 1995
IRRI RD23/Olong F2 QTL 2003 109(6) IRRI RD23/Olong F2 QTL 2003
JHNAES Din/SR-5 QTL 1998 86(2) JHNAES Din/SR-5 QTL 1998
JHPRC Rei/Yamd QTL 2002 13(2) JHPRC Rei/Yamd QTL 2002
JIC IR20/63-83 F2 QTL 1998 37(2) JIC IR20/63-83 F2 QTL 1998
JKU Aso/IR24 QTL 1996 388(14) JKU Aso/IR24 QTL 1996
JKU Tai65/Oglab QTL 1998 165(10) JKU Tai65/Oglab QTL 1998
JNARC Noe29/Chu32 F3 QTL 2002 14(2) JNARC Noe29/Chu32 F3 QTL 2002
JNIAR Aki/Kosh DH QTL 2003 54(4) JNIAR Aki/Kosh DH QTL 2003
JNIG W1944/Peik QTL 2002 347(12) JNIG W1944/Peik QTL 2002
JRGP Nip/Kas F2 QTL 2000 1,120(23) JRGP Nip/Kas F2 QTL 2000
JUT Akihi/IRAT109 QTL 2004 5(1) JUT Akihi/IRAT109 QTL 2004
JUT IR36/Genj QTL 2004 204(9) JUT IR36/Genj QTL 2004
JUT Patnai/Goai F2 QTL 2004 246(12) JUT Patnai/Goai F2 QTL 2004
KRGRP Mil23/Gih QTL 1998 403(18) KRGRP Mil23/Gih QTL 1998
LSU Caiapo/IRGC103544 QTL 2004 36(4) LSU Caiapo/IRGC103544 QTL 2004
M202/IR50 UCD QTL 2003 93(6) M202/IR50 UCD QTL 2003
MU CT9993/IR6226 QTL 2004 300(14) MU CT9993/IR6226 QTL 2004
NCGEB IR67819 RI QTL 2001 3(1) NCGEB IR67819 RI QTL 2001
NDSU EM93/SS18 BC QTL 2004 98(4) NDSU EM93/SS18 BC QTL 2004
NIAR Nip/Owar F4 QTL 2001 110(9) NIAR Nip/Owar F4 QTL 2001
NIAR PI312777/Rex F2 QTL 2001 244(17) NIAR PI312777/Rex F2 QTL 2001
NIAS Kosh/Kas BIL QTL 2003 272(10) NIAS Kosh/Kas BIL QTL 2003
NIAS Sas/Hab BCIL QTL 2003 257(12) NIAS Sas/Hab BCIL QTL 2003
Sussex IR55178 QTL 2001 38(1) Sussex IR55178 QTL 2001
TAMU Lem/Teq RI QTL 1995 241(9) TAMU Lem/Teq RI QTL 1995
TKU Integrated QTL 2002 262(12) TKU Integrated QTL 2002
TKU RD21A/IR24 B1F1 QTL 1998 12(1) TKU RD21A/IR24 B1F1 QTL 1998
TNCGEB CT9993/IR6226 QTL 2004 316(13) TNCGEB CT9993/IR6226 QTL 2004
TTU IR58821/IR52561 QTL 2002 168(7) TTU IR58821/IR52561 QTL 2002
TTU IR64/Orufi RI QTL 2003 118(8) TTU IR64/Orufi RI QTL 2003
UCD IR40931/PI543851 QTL 1996 - UCD IR40931/PI543851 QTL 1996
UCD Lab/Bla QTL 1998 202(10) UCD Lab/Bla QTL 1998
UKUW Bala/Azu QTL 1997 537(18) UKUW Bala/Azu QTL 1997
Wuhan B5/Ming63 F2 QTL 2000 17(2) Wuhan B5/Ming63 F2 QTL 2000
Zejiang IR64/Azu DH QTL 2001 227(11) Zejiang IR64/Azu DH QTL 2001
Zh97/Ming63 CNHZAU F2 QTL 1999 199(11) Zh97/Ming63 CNHZAU F2 QTL 1999
Zhejian IR1552/Azu RI QTL 2001 138(9) Zhejian IR1552/Azu RI QTL 2001
Oryza sativa indica x Oryza nivara USMSU O sativa CL16/O.nivara 80470 SSR QTL 2006 61(4) USMSU O sativa CL16/O.nivara 80470 SSR QTL 2006 Oryza sativa indica x Oryza nivara
Pearl Millet FLES Sou/Mol QTL 2000 - FLES Sou/Mol QTL 2000 Pearl Millet
FLES Thi/Wil QTL 2002 - FLES Thi/Wil QTL 2002
GUA LGD1/ICMP F2 RFLP QTL 2004 116(5) GUA LGD1/ICMP F2 RFLP QTL 2004
IGER H77/BRLT QTL 2002 - IGER H77/BRLT QTL 2002
IGER ICMB/863B QTL 2004 - IGER ICMB/863B QTL 2004
Sorghum UGA BTx623/IS3620C RL SSR RFLP QTL 2006 7(1) UGA BTx623/IS3620C RL SSR RFLP QTL 2006 Sorghum
UGA BTx623/S. propinquum F2 RFLP SSR QTL 2006 - UGA BTx623/S. propinquum F2 RFLP SSR QTL 2006
Tetraploid wheat ICARDA Omra/T.dico QTL 2004 - ICARDA Omra/T.dico QTL 2004 Tetraploid wheat
NDSU Langdon QTL 2002 - NDSU Langdon QTL 2002
Wheat AAFCCRC Wuhan1/ Marin QTL 2003 - AAFCCRC Wuhan1/ Marin QTL 2003 Wheat
Cheyenne/Wichita RI RFLP QTL 1999 - Cheyenne/Wichita RI RFLP QTL 1999
Geneva/Augusta RI RFLP QTL 2000 - Geneva/Augusta RI RFLP QTL 2000
Synthetic/Opata RI RFLP/SSR QTL 1995 17(3) Synthetic/Opata RI RFLP/SSR QTL 1995
UMN ND2603/Butte QTL 2003 - UMN ND2603/Butte QTL 2003
UMN Sumai/Stoa QTL 1999 - UMN Sumai/Stoa QTL 1999
UMN Sumai/Stoa QTL 2003 - UMN Sumai/Stoa QTL 2003
WL711/HD29 KBunt SSR QTL 2003 - WL711/HD29 KBunt SSR QTL 2003
Wheat composite QTL 2004 17(3) Wheat composite QTL 2004
Wild rice Minnesota John/Dor F2 QTL 2000 102(7) Minnesota John/Dor F2 QTL 2000 Wild rice
   
  Aberdeen Bala/Azu QTL 2002  
Legend: Correspondences (Corresponding Maps)