grain_iconCMap Home | Maps | Map Search | Feature Search | Matrix | Map Sets | Feature Types | Map Types | Evidence Types | Species | Saved Links | Help | Tutorial  

Welcome to the Matrix

Each cell in the matrix shows the number of correspondences between apair of maps. A correspondence is any relationship between two features.

Restrict Reference Sets By:         Use Colors Hide Empty Rows
Reference Set Physical Reference Set
Maize
  FPC maize May 2006  
   
Sequence Brachypodium distachyon Brachypodium distachyon 1.0 36,472 Brachypodium distachyon 1.0 Brachypodium distachyon Sequence
Oryza sativa Gramene IRGSP Assm 2005 1,048 Gramene IRGSP Assm 2005 Oryza sativa
Class I SSR (93-11) 2005 - Class I SSR (93-11) 2005
Class I SSR (IRGSP) 2005 - Class I SSR (IRGSP) 2005
Class I SSR (TIGR) 2005 - Class I SSR (TIGR) 2005
Oryza sativa indica BGI 93-11 Sequence 2005 - BGI 93-11 Sequence 2005 Oryza sativa indica
Oryza sativa japonica Gramene Annotated Nipponbare Sequence 2009 56,649 Gramene Annotated Nipponbare Sequence 2009 Oryza sativa japonica
IARI Nipponbare SSR 2009 - IARI Nipponbare SSR 2009
Sorghum Sorghum bicolor JGI8X 2007 76,726 Sorghum bicolor JGI8X 2007 Sorghum
Physical Wheat IWGSC Physical 3B 12 IWGSC Physical 3B Wheat Physical
Bin Maize Bins 6,555 Bins Maize Bin
Cytogenetic Maize CMM Cytogenetic FISH 2007 13 CMM Cytogenetic FISH 2007 Maize Cytogenetic
Deletion Wheat wEST 2003 - wEST 2003 Wheat Deletion
Genetic Aegilops tauschii Dvorak 2009 - Dvorak 2009 Aegilops tauschii Genetic
Barley Barley consensus - 1995 4 Barley consensus - 1995 Barley
Barley consensus 2 - 1996 4 Barley consensus 2 - 1996
Barley consensus 2003 - Barley consensus 2003
Barley genes 2 - 1997 - Barley genes 2 - 1997
Close 2943-SNP 2009 4 Close 2943-SNP 2009
NABGMP SxM 1993 - NABGMP SxM 1993
Barley, Consensus 2006, Stein - Barley, Consensus 2006, Stein
Foxtail millet Devos 2011 - Devos 2011 Foxtail millet
Maize BNL 1996 2,006 BNL 1996 Maize
Cornell Wilson 1999 482 Cornell Wilson 1999
IBM 2002 6,736 IBM 2002
IBM2 2008 Neighbors 5,203 IBM2 2008 Neighbors
Nested Association Mapping (NAM) 2008 2,613 Nested Association Mapping (NAM) 2008
SSR IBM 2001 5,669 SSR IBM 2001
UMC 1998 23,974 UMC 1998
Oat Cornell Diploid 1995 86 Cornell Diploid 1995 Oat
Oat, KxO, 2003 32 Oat, KxO, 2003
Oryza sativa CIAT SSR 2006 - CIAT SSR 2006 Oryza sativa
Cornell SSR 2001 32 Cornell SSR 2001
IGCN 1998 104 IGCN 1998
IRMI 2003 - IRMI 2003
JRGP RFLP 2000 765 JRGP RFLP 2000
KRGRP 1998 47 KRGRP 1998
Hokkaido Morphological 2000 - Hokkaido Morphological 2000
Niigata RFLP 2000 55 Niigata RFLP 2000
TTU CTIR 2000 68 TTU CTIR 2000
TTU IRIR 2000 23 TTU IRIR 2000
Oryza sativa x Oryza eichingeri IGCN sativa/eichingeri RFLP 55 IGCN sativa/eichingeri RFLP Oryza sativa x Oryza eichingeri
Oryza sativa x Oryza longistaminata Cornell RFLP 1994 103 Cornell RFLP 1994 Oryza sativa x Oryza longistaminata
Cornell RFLP 2001 378 Cornell RFLP 2001
Oryza sativa x Oryza rufipogon Huazhong RFLP 1997 90 Huazhong RFLP 1997 Oryza sativa x Oryza rufipogon
Pearl Millet JIC 81B/ICMP 2004 68 JIC 81B/ICMP 2004 Pearl Millet
JIC ICMB/863B 2004 - JIC ICMB/863B 2004
JIC LGD1/ICMP 2004 36 JIC LGD1/ICMP 2004
JIC PT732B/P1449 2004 - JIC PT732B/P1449 2004
Rye Rye, Ds2 x RxL10 1993 11 Rye, Ds2 x RxL10 1993 Rye
Sorghum Klein 2004 426 Klein 2004 Sorghum
Mace 2009 488 Mace 2009
Paterson 2003 2,228 Paterson 2003
Switchgrass Okada 2010 - Okada 2010 Switchgrass
Wheat Composite 2004 70 Composite 2004 Wheat
Consensus SSR 2004 - Consensus SSR 2004
Cornell Synthetic/Opata 1995 47 Cornell Synthetic/Opata 1995
Wheat genes - 1993 - Wheat genes - 1993
QTL Barley Apex/H. spontaneum BC SSR QTL 2003 - Apex/H. spontaneum BC SSR QTL 2003 Barley QTL
Galleon/Haruna nijo RFLP/AFLP/SSR QTL 2003 - Galleon/Haruna nijo RFLP/AFLP/SSR QTL 2003
JIC Igr/Tri QTL 1995 - JIC Igr/Tri QTL 1995
NCSL Zhed/ND//Fos QTL 2003 - NCSL Zhed/ND//Fos QTL 2003
OSU Har/Mor QTL 2000 - OSU Har/Mor QTL 2000
Steptoe/Morex DH RFLP QTL 2006 - Steptoe/Morex DH RFLP QTL 2006
Tadmor/Er Apm RI RFLP/AFLP/SSR QTL 1998 - Tadmor/Er Apm RI RFLP/AFLP/SSR QTL 1998
UMN Fred/Stan QTL 2003 6 UMN Fred/Stan QTL 2003
Foxtail millet UM B100/A10 QTL 2004 180 UM B100/A10 QTL 2004 Foxtail millet
Maize Bologna Os420/Iab78 QTL 1998 1,273 Bologna Os420/Iab78 QTL 1998 Maize
CIMMYT Ac7729/Ac7643S QTL 1996 601 CIMMYT Ac7729/Ac7643S QTL 1996
INRA Io/F2 Composite QTL 1996 1,404 INRA Io/F2 Composite QTL 1996
Iowa Mo17/H99 RI QTL 1996 308 Iowa Mo17/H99 RI QTL 1996
MISCU H123/AG19 BC1 QTL 2003 - MISCU H123/AG19 BC1 QTL 2003
Maize Bins QTL 2005 16,880 Maize Bins QTL 2005
NCSU B73/Mo17 QTL 1992 214 NCSU B73/Mo17 QTL 1992
UWM B73/Mo17 RFLP SSR QTL 1996 977 UWM B73/Mo17 RFLP SSR QTL 1996
Oat Cornell Kan/Ogl QTL 1995 - Cornell Kan/Ogl QTL 1995 Oat
Oryza sativa AGEBC KDM105/CT999 RI QTL 2000 64 AGEBC KDM105/CT999 RI QTL 2000 Oryza sativa
Aberdeen Bala/Azu QTL 2002 46 Aberdeen Bala/Azu QTL 2002
Brazil BG90-2/RS16 QTL 2002 - Brazil BG90-2/RS16 QTL 2002
CAU IRAT109/YUEFU QTL 2004 58 CAU IRAT109/YUEFU QTL 2004
CIRAD IR64/Azu DH QTL 2003 318 CIRAD IR64/Azu DH QTL 2003
CNCAU Orufi/Gui2 BC1 QTL 2001 61 CNCAU Orufi/Gui2 BC1 QTL 2001
CNHAU Zhenshan 97/IRAT109 SSR QTL 2006 - CNHAU Zhenshan 97/IRAT109 SSR QTL 2006
CNHAU Zhen97/ H94 QTL 2005 - CNHAU Zhen97/ H94 QTL 2005
CNHZAU 3037/2428 BC1F1QTL 1997 - CNHZAU 3037/2428 BC1F1QTL 1997
CNHZAU 3037/2428 F2 QTL 1997 - CNHZAU 3037/2428 F2 QTL 1997
CNHZAU 58S/1514 F2 QTL 1999 - CNHZAU 58S/1514 F2 QTL 1999
CNHZAU Bal/Dul//Naj11 QTL 1998 15 CNHZAU Bal/Dul//Naj11 QTL 1998
CNHZAU Pei/8902 QTL 1999 62 CNHZAU Pei/8902 QTL 1999
CNHZAU Zh97/Ming63 RI QTL 2002 58 CNHZAU Zh97/Ming63 RI QTL 2002
CNHZAU Zhe97/Wuy2 QTL 2004 - CNHZAU Zhe97/Wuy2 QTL 2004
CNNAU IR50/Tatsumimochi/Miyukimochi SSR QTL 2006 - CNNAU IR50/Tatsumimochi/Miyukimochi SSR QTL 2006
CNNJAU Tai65/Bhad QTL 2002 25 CNNJAU Tai65/Bhad QTL 2002
CNRRI Tes/CB QTL 1997 10 CNRRI Tes/CB QTL 1997
CNRRI Tes/CB QTL 1998 - CNRRI Tes/CB QTL 1998
CNRRI Wai/CB QTL 1996 10 CNRRI Wai/CB QTL 1996
CNRRI XeiB/Mil46 RI QTL 2002 11 CNRRI XeiB/Mil46 RI QTL 2002
CNRRI Zh97B/Mil46 RI QTL 2002 13 CNRRI Zh97B/Mil46 RI QTL 2002
CNSIPPE Non/Kos QTL 2004 74 CNSIPPE Non/Kos QTL 2004
CNWHU B5/Min63 QTL 2004 5 CNWHU B5/Min63 QTL 2004
CNYU Bal/Nan//Bal BC1 QTL 2001 - CNYU Bal/Nan//Bal BC1 QTL 2001
CNYU Naj11/Bal DH QTL 1999 66 CNYU Naj11/Bal DH QTL 1999
CNZU IR1552/Azu RI QTL 2003 18 CNZU IR1552/Azu RI QTL 2003
CNZU IR1552/Azu RI QTL 2004 18 CNZU IR1552/Azu RI QTL 2004
CNZU IR20/IR55178 RI QTL 1998 - CNZU IR20/IR55178 RI QTL 1998
CTIR CT9993/IR6226 QTL 2000 68 CTIR CT9993/IR6226 QTL 2000
Cornell 9024/LH422 RI QTL 1996 63 Cornell 9024/LH422 RI QTL 1996
Cornell IR64/Azu DH QTL 2001 32 Cornell IR64/Azu DH QTL 2001
Cornell IR64/IRG105 QTL 2003 3 Cornell IR64/IRG105 QTL 2003
Cornell Jef/Oruf BC QTL 2003 7 Cornell Jef/Oruf BC QTL 2003
Cornell V20A/Oruf QTL 1998 39 Cornell V20A/Oruf QTL 1998
Cornell V20A/glab QTL 2004 21 Cornell V20A/glab QTL 2004
FAUF Gui630/Twj DH QTL 2001 35 FAUF Gui630/Twj DH QTL 2001
HNAES MIL23/Aki RI QTL 2001 - HNAES MIL23/Aki RI QTL 2001
IGCAS Jas85/Lem F2 QTL 2000 41 IGCAS Jas85/Lem F2 QTL 2000
IGCAS ZYQ8/JX17 DH QTL 2000 51 IGCAS ZYQ8/JX17 DH QTL 2000
IGCAS ZYQ8/JX17 F2 QTL 1995 - IGCAS ZYQ8/JX17 F2 QTL 1995
IGCN ZYQ18/JX17 DH QTL 1998 104 IGCN ZYQ18/JX17 DH QTL 1998
IGCN ZYQ8/JX17 RI QTL 2001 81 IGCN ZYQ8/JX17 RI QTL 2001
INDIR IR58025/O. rufipogon BC SSR QTL 2005 - INDIR IR58025/O. rufipogon BC SSR QTL 2005
IRRI IR622/IR600 QTL 2003 64 IRRI IR622/IR600 QTL 2003
IRRI IR64/Azu DH QTL 2003 74 IRRI IR64/Azu DH QTL 2003
IRRI IR74/Jalmagna RI AFLP/RFLP QTL 2001 3 IRRI IR74/Jalmagna RI AFLP/RFLP QTL 2001
IRRI Lem/Teq RI QTL 2001 68 IRRI Lem/Teq RI QTL 2001
IRRI Mil23/Aki RI QTL 2003 52 IRRI Mil23/Aki RI QTL 2003
IRRI Mor/CO39 QTL 1994 35 IRRI Mor/CO39 QTL 1994
IRRI Pal/IR42 F2 QTL 1995 21 IRRI Pal/IR42 F2 QTL 1995
IRRI RD23/Olong F2 QTL 2003 - IRRI RD23/Olong F2 QTL 2003
JHNAES Din/SR-5 QTL 1998 12 JHNAES Din/SR-5 QTL 1998
JHPRC Rei/Yamd QTL 2002 - JHPRC Rei/Yamd QTL 2002
JIC IR20/63-83 F2 QTL 1998 25 JIC IR20/63-83 F2 QTL 1998
JKU Aso/IR24 QTL 1996 191 JKU Aso/IR24 QTL 1996
JKU Tai65/Oglab QTL 1998 28 JKU Tai65/Oglab QTL 1998
JNARC Noe29/Chu32 F3 QTL 2002 13 JNARC Noe29/Chu32 F3 QTL 2002
JNIAR Aki/Kosh DH QTL 2003 44 JNIAR Aki/Kosh DH QTL 2003
JNIG W1944/Peik QTL 2002 86 JNIG W1944/Peik QTL 2002
JRGP Nip/Kas F2 QTL 2000 856 JRGP Nip/Kas F2 QTL 2000
JUT Akihi/IRAT109 QTL 2004 - JUT Akihi/IRAT109 QTL 2004
JUT IR36/Genj QTL 2004 57 JUT IR36/Genj QTL 2004
JUT Patnai/Goai F2 QTL 2004 42 JUT Patnai/Goai F2 QTL 2004
KRGRP Mil23/Gih QTL 1998 47 KRGRP Mil23/Gih QTL 1998
LSU Caiapo/IRGC103544 QTL 2004 - LSU Caiapo/IRGC103544 QTL 2004
M202/IR50 UCD QTL 2003 - M202/IR50 UCD QTL 2003
MU CT9993/IR6226 QTL 2004 70 MU CT9993/IR6226 QTL 2004
NCGEB IR67819 RI QTL 2001 - NCGEB IR67819 RI QTL 2001
NDSU EM93/SS18 BC QTL 2004 - NDSU EM93/SS18 BC QTL 2004
NIAR Nip/Owar F4 QTL 2001 32 NIAR Nip/Owar F4 QTL 2001
NIAR PI312777/Rex F2 QTL 2001 73 NIAR PI312777/Rex F2 QTL 2001
NIAS Kosh/Kas BIL QTL 2003 94 NIAS Kosh/Kas BIL QTL 2003
NIAS Sas/Hab BCIL QTL 2003 121 NIAS Sas/Hab BCIL QTL 2003
Sussex IR55178 QTL 2001 12 Sussex IR55178 QTL 2001
TAMU Lem/Teq RI QTL 1995 1 TAMU Lem/Teq RI QTL 1995
TKU Integrated QTL 2002 57 TKU Integrated QTL 2002
TKU RD21A/IR24 B1F1 QTL 1998 - TKU RD21A/IR24 B1F1 QTL 1998
TNCGEB CT9993/IR6226 QTL 2004 68 TNCGEB CT9993/IR6226 QTL 2004
TTU IR58821/IR52561 QTL 2002 23 TTU IR58821/IR52561 QTL 2002
TTU IR64/Orufi RI QTL 2003 65 TTU IR64/Orufi RI QTL 2003
UCD IR40931/PI543851 QTL 1996 19 UCD IR40931/PI543851 QTL 1996
UCD Lab/Bla QTL 1998 35 UCD Lab/Bla QTL 1998
UKUW Bala/Azu QTL 1997 24 UKUW Bala/Azu QTL 1997
Wuhan B5/Ming63 F2 QTL 2000 3 Wuhan B5/Ming63 F2 QTL 2000
Zejiang IR64/Azu DH QTL 2001 13 Zejiang IR64/Azu DH QTL 2001
Zh97/Ming63 CNHZAU F2 QTL 1999 56 Zh97/Ming63 CNHZAU F2 QTL 1999
Zhejian IR1552/Azu RI QTL 2001 17 Zhejian IR1552/Azu RI QTL 2001
Oryza sativa indica x Oryza nivara USMSU O sativa CL16/O.nivara 80470 SSR QTL 2006 - USMSU O sativa CL16/O.nivara 80470 SSR QTL 2006 Oryza sativa indica x Oryza nivara
Pearl Millet FLES Sou/Mol QTL 2000 - FLES Sou/Mol QTL 2000 Pearl Millet
FLES Thi/Wil QTL 2002 19 FLES Thi/Wil QTL 2002
GUA LGD1/ICMP F2 RFLP QTL 2004 36 GUA LGD1/ICMP F2 RFLP QTL 2004
IGER H77/BRLT QTL 2002 - IGER H77/BRLT QTL 2002
IGER ICMB/863B QTL 2004 - IGER ICMB/863B QTL 2004
Sorghum UGA BTx623/IS3620C RL SSR RFLP QTL 2006 322 UGA BTx623/IS3620C RL SSR RFLP QTL 2006 Sorghum
UGA BTx623/S. propinquum F2 RFLP SSR QTL 2006 12 UGA BTx623/S. propinquum F2 RFLP SSR QTL 2006
Tetraploid wheat ICARDA Omra/T.dico QTL 2004 - ICARDA Omra/T.dico QTL 2004 Tetraploid wheat
NDSU Langdon QTL 2002 - NDSU Langdon QTL 2002
Wheat AAFCCRC Wuhan1/ Marin QTL 2003 - AAFCCRC Wuhan1/ Marin QTL 2003 Wheat
Cheyenne/Wichita RI RFLP QTL 1999 - Cheyenne/Wichita RI RFLP QTL 1999
Geneva/Augusta RI RFLP QTL 2000 - Geneva/Augusta RI RFLP QTL 2000
Synthetic/Opata RI RFLP/SSR QTL 1995 47 Synthetic/Opata RI RFLP/SSR QTL 1995
UMN ND2603/Butte QTL 2003 - UMN ND2603/Butte QTL 2003
UMN Sumai/Stoa QTL 1999 - UMN Sumai/Stoa QTL 1999
UMN Sumai/Stoa QTL 2003 - UMN Sumai/Stoa QTL 2003
WL711/HD29 KBunt SSR QTL 2003 - WL711/HD29 KBunt SSR QTL 2003
Wheat composite QTL 2004 70 Wheat composite QTL 2004
Wild rice Minnesota John/Dor F2 QTL 2000 60 Minnesota John/Dor F2 QTL 2000 Wild rice
   
  FPC maize May 2006  
Legend: Correspondences (Corresponding Maps)