Repeat motif: (CT)37 highlighted on FASTA sequence in red (if found).
Related Sequences (4)
>RM101_forward Oryza sativa Japonica Group Primer [26 bp]. Associated to 'RM101' via primer_forward
gtgaatggtcaagtgacttaggtggc
>RM101_reverse Oryza sativa Japonica Group Primer [23 bp]. Associated to 'RM101' via primer_reverse
acacaacatgttccctcccatgc
>D17586 Oryza sativa Japonica Group Genomic DNA [6399 bp]. Associated to 'RM101' via contained_in_sequence
GGATCCAGATTATAATAAGTTATTTCAATAAGTTATTGTTGTCTGTTTCTTTCAGCTTACTTTCAATAATTTGGATTATA
ATAATCCCAAACTTTGGAAGAAACAGGGCCTTAATAGGTGGAGACTGCAGAGGCTCGTTGCTAACGTCGTGATGCCGTAC
ATGTGTTGTCATTTTGCTGACAACCAGCCAATTTTTGTCGGCAATGTAACTCCTTGCTACTCCGTACTACGAGTACTATA
CTTGGCCCAAACACAAGTGCACAACCATATGCTTTTGTTGCGCTCGAAACCACCAGCCTCCTCGCGTCAGGAGGCGCAAC
TGCGCGTGCAAACAAAAGCCAACGAAACCGCTCCCAAAATTCGAAGAGACGAATCTCGCCAGAATTCGGTTCAAAACTCG
CCAAATTTATCCGACCAAGAAATCGGTATAAAAGACCCACGCCGTCGCCGTCACCTCTCATCGTGCCTTGGACGCCAATT
CTCTCTCTCTCTCTTCTATCCGTGCGCCTCAACTTTCCCACCACCACCGCGGTCTCCACTGCGCCACGCTGCTGCCGACC
ACCCGCACCATCGATGGCCAGGCGCGGCCGCCGCTCCCTTGCTTCGCCCGCCGTTGCCATCGCCCTTTTCGTCTTCCTCG
CCTACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTATGCGAGGCCGCGCCGGCGAGCGCGGTCGTGAAGAGCGTCCCGGGATTC
GACGGCGCCCTCCCGTCGAAGCACTACGCCGGGTACGTACGCGCGCCTCCGCCCCCCGCGCCGTCGCGCCGCGCGCGCGC
GCTTGCTGGCTTGCTGCTGCTAACATCTACTAGCTCGTGTCGTGTGGCGGCGGCGGCGGCGTGCAGGTACGTGACGGTGG
AGGAGCAGCACGGGCGGAACCTGTTCTACTACCTGGTGGAGTCGGAGCGCGACCCGGCGAAGGACCCCCTCGTGCTCTGG
CTCAACGGCGGCCCCGGCTGCTCCAGCTTCGACGGCTTCGTCTACGAGCACGGTGCGTATATCCCATCCACACACACACA
CCTCCTGCCCCCTCGCCGTCGCCGGAGCTAGCCTCCGGCCGCGGCGCGTTGCGGCGGCGAGTCGTCTCGTCGTGGTTGAG
GGCTTGAGGCTGGCGGCCGCAGCTCGCCGTGGAAGGAAGGGGAGGTGGTGGGCCCCGCTGCTTTTGCTTTCGATTATTAT
ATTCGATGGCCTTTTCACCACAAATCGCGTAAAAAGCTGCAGCGTAGTTGAGATTTGAGCTTCTATTTTGATTTGTTCTG
TTTTTTTTAGCCAAACAAAAAAGAAGAATCTCTGATCTGAGTCTGCACTCTGCACACGGCTGTTGCGTGCAACTGACTGT
TGTGACCCCCTTCTAGATTGGTTTTTTTCCCGAGGGAGTACATCATTGGATAATGGATAACCAAATACTTTCTCTGTTCC
AAGAAAAAAATTAACCTCGTACATTATGCGACACATTCTGATACAATGAATTTGAATATACTCTATATTTAGATTCGTTA
TATTAGGATATGTCACATCCTAGTATTATATTTCCTTTTTTAGGATGAAGGTGTGACATATTCTAGTACTATGAATTTAG
ACATAGTATGTCCAGATTCATAGTAGTAGGATGTATCACATCTTATCCTAAATTCACTTTTTATGAGACGGAGGTAGTAT
TTCTATCACCGCAAGAATTGACTTATTTAGTTGGGAACTTGGTTGACACGATAATGGATTATCTATAGTTGATTTTTAGA
TATATACTTATATGTTAAAACATTTTAGGAAATAAATAATAAATAGTTTTAAACAAGTGGTTTAAGAAATACAGTACACA
AATTCTTTTCTATTTGAGAAATTATATTGTTAAAAACGTGGAGTAAATAATCTACCACAATAATTTGGTAAATAAGCTGA
AAAGAACAACTCACACAGTGGCGTTCATCTCTATATCATTTTCATTTTTAATATCTCAGTCCTTCAAGAAGAGAAGTCTT
CATTTTGTTTAATTCCAGCCTTAACACAACTGGTTGATGGGGCTTGATGATTCGTGTGGTTGAACCTGATCATTATTATG
CACCAGTTCATATGTGTGCGTGTGCTTTCCAGGACCATTCAATTTCGAGTCAGGAGGGTCAGCCAAGAGCCTACCGAAGC
TTCATCTCAATCCCTATAGCTGGTCCAAGGTTGGCCATGCCCATATATCTATTGGCCCTGCATACATAATGAGCTGAAAT
TTTCTGTTGTCTGAATGAGACTGGTGATATTTTTCTGTGTGTGAGCTTAGGTATCCAGTGTGATCTACTTGGATTCCCCT
GCTGGTGTGGGGCTGTCATACTCCAAGAATACTTCGGATTATAACACCGGGGACCTCAAGACCGCCGCGGATTCGCATAC
TTTTCTTCTGAAGGTACTATATATGTGTGTTCTATAATTTTCAGTATGGTGAATTAAAATCATCTGCCTGTGCAAGATAG
CTGAATTTTGTTATATCTTGTCAGCAGTGGTTTCAGCTGTACCCTGAGTTCCTGAGCAATCCATTTTACATAGCTGGGGA
GTCGTATGCTGGGGTTTATGTTCCTACTCTTTCGCATGAAGTTGTCAAAGGTATTTTTCTTTGAGTTAGGATTGTTCTCA
TGTTGCAACAATTAACACACATCTTATGGTCTTGTTTTTTATGAATTGTTATGCAGGATTACATGATGGAGTGAAGCCTA
CAATAAACTTCAAGGTTACATATTGATCAATGGAAGTTTTCTATTAGGAGGTCTATAGTTTAACATGTATCTAATTTGGA
TTTGAATGTCAGGGCTACATGGTCGGAAATGGTGTTTGCGACACTGTTTTTGATGGTAATGCTCTTGTGCCATTTGCTCA
TGGAATGGCTCTAATTTCAGACGATATATACCAGGTAAGTCCACTATTCAGATTGAAAGCCCCATTTCAGTAATATTTCC
CCTACACATTATGAGAAAGAATCAGAGTACCCTTTTTTCATATTCTATGGATTTTTTTCCCCAAAAGTTGTTTTTTCGGT
TCCATTGATCTTTAGGAGATCACTTTTATATATGTACTTCTGCACACAATTTCAAACAGACTCTACTTTGGAATATGATT
GAATGGACTAAACACCATTTACACAATTCTATGTATTCAAAATTCAGGAAGCTCAGACTGCATGCCACGGAAACTACTGG
AATACTACCACTGATAAATGTGAAAATGCACTCTACAAAGTCGATACGGTAATAAACCGCCGTGTTACTTCATCTGATTA
AAGATATCATTGAATCAACGCTGTTCTCCTTATGATATACCTTGTTCTTGTGCAGTCAATTAATGACCTAAATATTTATG
ACATTCTTGAGCCATGCTACCACAGCAAAACTATCAAGAAAGTGACCCCAGCAAATACCAAATTGCCCAAAAGTTTCCAA
CATCTTGGTACAACTACCAAGCCCCTTGCTGTAAGAACAAGAATGCATGGGCGTGCTTGGCCTCTGAGAGCTCCTGTGAG
AGCGGGGCGTGTGCCATCCTGGCAGGAGTTTGCCAGAGGATCTCGCCCCAGTGGAGTTCCTTGTATGGTAAGCTCAATAT
CTCTCGATTCTCTCCCAAAAGAAAAATGTGGACAGATGTGTAGCTATGAATCTGGACAGATGTGTAATGTGTCCTGGTTC
ATAGCTAGGAATTCTTTTTTTTTTCTTTTTTGGACGGAGGGTGTATTTTCTAGTGGTATGTGAGATTGCGAGAATGGTAT
GTTGCAGTCTTGCAGAAATATTGGTCCATTTTGTGCTAACATGGAAAGTATGCATTGATATTTTTATACCTTCCTTTCCA
ACAAAGAAATCCCTGACTTATATTTAAATATGACTGCTAAGAGCATGTTCAACAGTCATTAATAAGAGGCTCTTAACCTT
GACAACTACACATGTTTTTATAATTTACAGAAGAATTTCTGGAAGAATGCCTGATGCATTCATGGAGGACTTTATTAACT
GACAGCCTCTAATTTGCTTAAACTGCAGAGTGATGAAGTTGCAACAGCATGGCTGAACAACGATGACGTCAGAGCAGCAA
TTCATGCCCAACCAGTATGGCAATCATTTAGTGACGACCCAGAATTAGATAGAATTTTACAATATTTTCATCTTACAACT
TTAATTTATTACATACGCTCATGATAGGTAAGCTCAATTGGCTCGTGGCTTATATGCACCAACGTGTTGGATTTCATCCA
TGATGCTGGAAGTATGATCAGTTATCACAAGAACCTCACAGGCCAGGGTTATCGTGCTTTCATATACAGGTCCGACATGT
GCCTATAAAAACGATGTTTTCACAAAAAAAATTTCCTACCCTATTGATTGGTTATGGATCTTAGAGGGAACGTCCTTATT
AACTTCTGAATTATAAAAAATAGCTTTTCGCAGGTGGGAAAAAGGCGAATTTTGTGCCAGCTTTTTTTATTTCACATCCT
ATACTCTTAGAAAAGAAAGTGTGATTCCAATGGTCATGGCATTTTGTTTTATATTTGTTACAGTGGTGATCATGATATGT
GTGTACCTTATACCGGGACTGAAGCATGGACCAGATCTTTGGGCTACGGAGTTATTGATTCATGGAGACCGTGGCACCTG
AATGGCCAAGTTTCTGGGTATTAATCACACGTATCCCCAAATTTTACTAGTTGAATTATTACCCTCAGAGTAAATTTACT
CAACAGCTGCTATCATTGCTTTTATGAAAGGAAACCAAAAGATTCTAATTGGATTTTATTTCCAGAAACTCAAACTATAT
AAATATATATGATATTCATCGGTCAGTCTACTTATATTATATTATGTAACTCGTCAGGTACACCCAAGGATATGAACATG
GCCTCACCTTTGCTACCATTAAGGTGAGTATACATTTCTAACCAGGGCATCACAATTAAGGTCAAAATGAATGTAATATG
GTTTGATTACCCACTTAAGTAAGAAGAGGACACAATATATAAACTAATATGATTGTATCATTCAAACACAAAAAATCTAA
AAAATTGAGGTTGAATTGCATTTAACTTTGTTTCCTTCCCTTTTCTTTTTCTTTGTTTGCAGGGTGCTGGGCACACTGTT
CCTGAATACAAACCACAAGAATCATTGGCTTTCTATAGCCGCTGGCTTGCTGGTTCTAAATTGTAAATGCTTGTGAATCC
GACATCCAATAATGGGAAGCATACATATCCATACAGCCATGAATCAGATAAAGGTTGATACAAAGATAATATAAAAAAAC
TACAAACCAATTTAGAAAGCCACATTTATTTCAGAATAGTTGGTGCCAACACCATGTTGTATGTTCTTTTATGCAAACAG
TAGATCATTCATCATTATTTGTGGAAGCTTACTGTGCTGTAACATCAAAATGTCAATCCTTTTTTCTGATATTTTGTATT
CTCAATTTCTGATTGTCAATCCAAAGCCACAAAGATAATTTGTAGATGGATTACAAGGTAATCTCTTGACATATTAATAT
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GAGATGTCCCATGTGATAATTCCCTTTTAGAGTAAATTGCATTTTTTAGCCATATATTCTTACCATAGTTTTACTTTTAA
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>D17586 Oryza sativa Japonica Group Genomic DNA [6399 bp]. Associated to 'RM101' via source_sequence
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GCTGGTGTGGGGCTGTCATACTCCAAGAATACTTCGGATTATAACACCGGGGACCTCAAGACCGCCGCGGATTCGCATAC
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TTTGAATGTCAGGGCTACATGGTCGGAAATGGTGTTTGCGACACTGTTTTTGATGGTAATGCTCTTGTGCCATTTGCTCA
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CCTACACATTATGAGAAAGAATCAGAGTACCCTTTTTTCATATTCTATGGATTTTTTTCCCCAAAAGTTGTTTTTTCGGT
TCCATTGATCTTTAGGAGATCACTTTTATATATGTACTTCTGCACACAATTTCAAACAGACTCTACTTTGGAATATGATT
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ATAGCTAGGAATTCTTTTTTTTTTCTTTTTTGGACGGAGGGTGTATTTTCTAGTGGTATGTGAGATTGCGAGAATGGTAT
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TTAATTTATTACATACGCTCATGATAGGTAAGCTCAATTGGCTCGTGGCTTATATGCACCAACGTGTTGGATTTCATCCA
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GCCTATAAAAACGATGTTTTCACAAAAAAAATTTCCTACCCTATTGATTGGTTATGGATCTTAGAGGGAACGTCCTTATT
AACTTCTGAATTATAAAAAATAGCTTTTCGCAGGTGGGAAAAAGGCGAATTTTGTGCCAGCTTTTTTTATTTCACATCCT
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AATGGCCAAGTTTCTGGGTATTAATCACACGTATCCCCAAATTTTACTAGTTGAATTATTACCCTCAGAGTAAATTTACT
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GCCTCACCTTTGCTACCATTAAGGTGAGTATACATTTCTAACCAGGGCATCACAATTAAGGTCAAAATGAATGTAATATG
GTTTGATTACCCACTTAAGTAAGAAGAGGACACAATATATAAACTAATATGATTGTATCATTCAAACACAAAAAATCTAA
AAAATTGAGGTTGAATTGCATTTAACTTTGTTTCCTTCCCTTTTCTTTTTCTTTGTTTGCAGGGTGCTGGGCACACTGTT
CCTGAATACAAACCACAAGAATCATTGGCTTTCTATAGCCGCTGGCTTGCTGGTTCTAAATTGTAAATGCTTGTGAATCC
GACATCCAATAATGGGAAGCATACATATCCATACAGCCATGAATCAGATAAAGGTTGATACAAAGATAATATAAAAAAAC
TACAAACCAATTTAGAAAGCCACATTTATTTCAGAATAGTTGGTGCCAACACCATGTTGTATGTTCTTTTATGCAAACAG
TAGATCATTCATCATTATTTGTGGAAGCTTACTGTGCTGTAACATCAAAATGTCAATCCTTTTTTCTGATATTTTGTATT
CTCAATTTCTGATTGTCAATCCAAAGCCACAAAGATAATTTGTAGATGGATTACAAGGTAATCTCTTGACATATTAATAT
TGGTCAGTATAATATTAATATTGTAGATGAAAAGAATGTCATTAAAATGTCAAACTAATAAGACAACAACCGCAGCACAA
ATGATAACAACTCCAAAAATAAATCAAAAGAAAGCATGTAAGGTGAATGGTCAAGTGACTTAGGTGGCTTTTTCTACATT
ATTTAACTTGTTTCCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCAATAATTGAAAGTATTGACTAAACGATACACACTTCGACCACTACTTTTTCAACAATAAACTTGTAAA
GAGTTGGAGCTCTGTACAATTATAAAAGTATAATAAAAAATGATTCCGAAAATATAACTTTAACACATAAAAATAATATA
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CCACTCTTGAAGTTTTGTTTTAAAAAAAATTGGATTAGGTATCGTTTGCCAAATATTGCAGTTTAAACATGGTAGTCCAC
ATGTCAATGGGACTAACATCTTTATTGTCTATGTGCCACTTACATGTGGGCCACCCGGTTCAAAGGGCAATATCTAGCCA
TAATACATATATAGTCCAAAGTGAAAACAAAACATTGTAAGGGCAGTACAAAGTTAAACATTGGTAGGCCCAAAGTGCAA
TTTACTCTTCCTTTTATAACCACAAACAATCATCCTGCTAAAAGGTTAAAAAAAAACTTCCATATACTCACATGAATTC
Align All Sequences