Assembly and Genebuild

Summary

Assembly:	v1.0, INSDC Assembly GCA_000143415.1, May 2011
Database version:	70.1
Base Pairs:	212,645,483
Golden Path Length:	212,645,483
Genebuild method	Generated from ENA and UniProtKB annotation

Gene counts

Coding genesA protein coding transcript is a spliced mRNA that leads to a protein product.:	34,799
Non coding genesTranscript does not result in a protein product. :	26
PseudogenesA noncoding sequence similar to an active protein. :	63
Gene transcripts:	34,914

Coordinate Systems

supercontig

759 sequences Sequence Length (bp) 173080HM173080 143775 377565GL377565 6951972 377566GL377566 6181961 377567GL377567 4463058 377568GL377568 4340499 377569GL377569 4143896 377570GL377570 4135178 377571GL377571 3967200 377572GL377572 3908038 377573GL377573 3666672 377574GL377574 3149477 377575GL377575 3093912 377576GL377576 2904818 377577GL377577 2902290 377578GL377578 2863689 377579GL377579 2757670 377580GL377580 2676847 377581GL377581 2470656 377582GL377582 2450372 377583GL377583 2350400 377584GL377584 2302610 377585GL377585 2305360 377586GL377586 2100764 377587GL377587 2094916 377588GL377588 2034879 377589GL377589 1997012 377590GL377590 2002060 377591GL377591 1973895 377592GL377592 1968041 377593GL377593 1968525 377594GL377594 1886115 377595GL377595 1905289 377596GL377596 1846953 377597GL377597 1840579 377598GL377598 1846321 377599GL377599 1796630 377600GL377600 1770965 377601GL377601 1749879 377602GL377602 1705930 377603GL377603 1751465 377604GL377604 1708524 377605GL377605 1743703 377606GL377606 1675513 377607GL377607 1658784 377608GL377608 1658729 377609GL377609 1630749 377610GL377610 1506775 377611GL377611 1511927 377612GL377612 1463349 377613GL377613 1464571 377614GL377614 1480447 377615GL377615 1473132 377616GL377616 1441712 377617GL377617 1451693 377618GL377618 1419048 377619GL377619 1387680 377620GL377620 1343795 377621GL377621 1299822 377622GL377622 1296709 377623GL377623 1263218 377624GL377624 1266795 377625GL377625 1246421 377626GL377626 1275566 377627GL377627 1161766 377628GL377628 1151164 377629GL377629 1143871 377630GL377630 1132267 377631GL377631 1098469 377632GL377632 1081329 377633GL377633 1049549 377634GL377634 1032227 377635GL377635 997799 377636GL377636 987446 377637GL377637 981669 377638GL377638 970821 377639GL377639 993844 377640GL377640 967469 377641GL377641 914710 377642GL377642 903794 377643GL377643 880892 377644GL377644 882469 377645GL377645 928904 377646GL377646 890268 377647GL377647 853333 377648GL377648 859278 377649GL377649 832636 377650GL377650 845143 377651GL377651 830751 377652GL377652 828699 377653GL377653 814213 377654GL377654 797443 377655GL377655 799544 377656GL377656 751281 377657GL377657 765235 377658GL377658 741856 377659GL377659 749943 377660GL377660 719092 377661GL377661 694339 377662GL377662 669108 377663GL377663 682814 377664GL377664 658485 377665GL377665 648882 377666GL377666 641370 377667GL377667 621399 377668GL377668 677250 377669GL377669 609495 377670GL377670 604567 377671GL377671 592856 377672GL377672 574352 377673GL377673 566005 377674GL377674 565628 377675GL377675 581462 377676GL377676 631273 377677GL377677 557149 377678GL377678 564560 377679GL377679 538028 377680GL377680 531270 377681GL377681 507213 377682GL377682 523344 377683GL377683 470017 377684GL377684 468280 377685GL377685 464292 377686GL377686 459265 377687GL377687 459191 377688GL377688 448815 377689GL377689 444406 377690GL377690 431578 377691GL377691 449091 377692GL377692 407360 377693GL377693 455116 377694GL377694 396342 377695GL377695 399968 377696GL377696 405333 377697GL377697 386168 377698GL377698 385285 377699GL377699 370657 377700GL377700 397141 377701GL377701 342514 377702GL377702 352132 377703GL377703 338253 377704GL377704 332063 377705GL377705 331334 377706GL377706 318016 377707GL377707 327661 377708GL377708 312035 377709GL377709 315748 377710GL377710 314664 377711GL377711 303747 377712GL377712 305859 377713GL377713 290367 377714GL377714 291167 377715GL377715 278539 377716GL377716 280317 377717GL377717 269209 377718GL377718 284029 377719GL377719 261321 377720GL377720 277980 377721GL377721 249751 377722GL377722 244270 377723GL377723 248900 377724GL377724 250944 377725GL377725 246263 377726GL377726 230390 377727GL377727 227397 377728GL377728 221646 377729GL377729 217020 377730GL377730 213958 377731GL377731 208377 377732GL377732 209583 377733GL377733 205192 377734GL377734 174619 377735GL377735 172752 377736GL377736 168850 377737GL377737 175582 377738GL377738 168007 377739GL377739 186484 377740GL377740 160093 377741GL377741 163202 377742GL377742 147933 377743GL377743 144185 377744GL377744 142894 377745GL377745 135481 377746GL377746 130751 377747GL377747 129267 377748GL377748 132105 377749GL377749 134442 377750GL377750 111737 377751GL377751 108019 377752GL377752 103126 377753GL377753 97325 377754GL377754 96435 377755GL377755 101322 377756GL377756 86265 377757GL377757 94266 377758GL377758 80095 377759GL377759 77676 377760GL377760 79886 377761GL377761 79028 377762GL377762 72821 377763GL377763 71919 377764GL377764 68368 377765GL377765 72714 377766GL377766 63322 377767GL377767 71197 377768GL377768 60688 377769GL377769 63066 377770GL377770 62593 377771GL377771 62181 377772GL377772 56476 377773GL377773 67497 377774GL377774 79741 377775GL377775 53970 377776GL377776 61776 377777GL377777 46685 377778GL377778 45011 377779GL377779 49034 377780GL377780 45678 377781GL377781 61683 377782GL377782 42361 377783GL377783 41569 377784GL377784 49426 377785GL377785 53752 377786GL377786 50919 377787GL377787 50069 377788GL377788 39467 377789GL377789 37778 377790GL377790 37071 377791GL377791 35277 377792GL377792 33047 377793GL377793 32947 377794GL377794 32614 377795GL377795 33187 377796GL377796 30535 377797GL377797 29902 377798GL377798 29518 377799GL377799 48657 377800GL377800 29859 377801GL377801 28838 377802GL377802 28579 377803GL377803 25291 377804GL377804 24566 377805GL377805 49021 377806GL377806 45385 377807GL377807 22936 377808GL377808 21604 377809GL377809 23465 377810GL377810 20893 377811GL377811 20820 377812GL377812 20938 377813GL377813 19817 377814GL377814 20045 377815GL377815 19105 377816GL377816 19054 377817GL377817 19012 377818GL377818 18961 377819GL377819 18569 377820GL377820 18545 377821GL377821 18746 377822GL377822 18435 377823GL377823 17785 377824GL377824 17327 377825GL377825 17007 377826GL377826 16105 377827GL377827 16095 377828GL377828 16110 377829GL377829 15550 377830GL377830 16278 377831GL377831 15533 377832GL377832 15264 377833GL377833 15260 377834GL377834 15232 377835GL377835 17499 377836GL377836 15108 377837GL377837 15098 377838GL377838 14995 377839GL377839 14987 377840GL377840 15096 377841GL377841 14869 377842GL377842 14811 377843GL377843 14525 377844GL377844 14490 377845GL377845 14285 377846GL377846 14177 377847GL377847 14116 377848GL377848 13984 377849GL377849 13780 377850GL377850 13762 377851GL377851 14045 377852GL377852 13567 377853GL377853 13654 377854GL377854 13911 377855GL377855 13471 377856GL377856 13436 377857GL377857 13383 377858GL377858 13500 377859GL377859 13200 377860GL377860 13199 377861GL377861 13170 377862GL377862 13127 377863GL377863 13215 377864GL377864 13035 377865GL377865 12830 377866GL377866 13002 377867GL377867 12540 377868GL377868 12462 377869GL377869 12173 377870GL377870 12104 377871GL377871 11814 377872GL377872 11757 377873GL377873 11707 377874GL377874 11688 377875GL377875 11684 377876GL377876 11532 377877GL377877 11819 377878GL377878 11470 377879GL377879 11272 377880GL377880 11248 377881GL377881 11221 377882GL377882 11171 377883GL377883 11381 377884GL377884 11132 377885GL377885 11206 377886GL377886 11094 377887GL377887 12073 377888GL377888 11205 377889GL377889 10956 377890GL377890 10874 377891GL377891 10820 377892GL377892 10938 377893GL377893 10765 377894GL377894 10732 377895GL377895 10541 377896GL377896 10606 377897GL377897 10555 377898GL377898 11825 377899GL377899 10176 377900GL377900 10176 377901GL377901 10097 377902GL377902 9969 377903GL377903 10115 377904GL377904 9869 377905GL377905 11257 377906GL377906 9638 377907GL377907 9525 377908GL377908 9473 377909GL377909 15404 377910GL377910 9386 377911GL377911 9838 377912GL377912 9320 377913GL377913 9405 377914GL377914 9289 377915GL377915 9946 377916GL377916 9278 377917GL377917 10679 377918GL377918 9144 377919GL377919 10311 377920GL377920 9088 377921GL377921 9145 377922GL377922 9027 377923GL377923 9009 377924GL377924 8939 377925GL377925 9160 377926GL377926 8687 377927GL377927 9306 377928GL377928 8676 377929GL377929 8896 377930GL377930 8640 377931GL377931 10063 377932GL377932 8606 377933GL377933 8488 377934GL377934 8419 377935GL377935 8415 377936GL377936 8408 377937GL377937 8458 377938GL377938 8347 377939GL377939 8270 377940GL377940 9356 377941GL377941 8234 377942GL377942 8574 377943GL377943 8189 377944GL377944 8073 377945GL377945 8049 377946GL377946 8025 377947GL377947 7993 377948GL377948 7974 377949GL377949 7954 377950GL377950 7925 377951GL377951 8865 377952GL377952 7973 377953GL377953 7863 377954GL377954 8069 377955GL377955 8691 377956GL377956 7904 377957GL377957 7900 377958GL377958 7794 377959GL377959 7783 377960GL377960 8618 377961GL377961 7788 377962GL377962 7671 377963GL377963 7669 377964GL377964 8998 377965GL377965 7768 377966GL377966 7683 377967GL377967 7581 377968GL377968 7511 377969GL377969 7505 377970GL377970 7386 377971GL377971 7838 377972GL377972 7688 377973GL377973 7446 377974GL377974 7237 377975GL377975 7277 377976GL377976 7095 377977GL377977 6987 377978GL377978 8375 377979GL377979 7363 377980GL377980 6947 377981GL377981 6844 377982GL377982 6933 377983GL377983 6817 377984GL377984 6746 377985GL377985 6742 377986GL377986 6660 377987GL377987 6570 377988GL377988 6722 377989GL377989 6491 377990GL377990 6488 377991GL377991 6571 377992GL377992 6656 377993GL377993 6854 377994GL377994 6792 377995GL377995 7010 377996GL377996 6402 377997GL377997 6400 377998GL377998 7343 377999GL377999 6379 378000GL378000 6377 378001GL378001 6329 378002GL378002 10510 378003GL378003 6292 378004GL378004 6207 378005GL378005 6607 378006GL378006 6176 378007GL378007 6153 378008GL378008 6138 378009GL378009 6093 378010GL378010 6442 378011GL378011 6072 378012GL378012 6053 378013GL378013 6131 378014GL378014 7095 378015GL378015 6124 378016GL378016 6667 378017GL378017 5793 378018GL378018 5918 378019GL378019 5770 378020GL378020 6904 378021GL378021 5702 378022GL378022 5679 378023GL378023 5763 378024GL378024 5642 378025GL378025 5651 378026GL378026 5532 378027GL378027 5517 378028GL378028 5517 378029GL378029 5501 378030GL378030 6343 378031GL378031 5858 378032GL378032 5427 378033GL378033 5385 378034GL378034 5377 378035GL378035 5471 378036GL378036 5457 378037GL378037 5488 378038GL378038 5320 378039GL378039 5319 378040GL378040 5317 378041GL378041 5311 378042GL378042 5585 378043GL378043 5254 378044GL378044 5252 378045GL378045 5242 378046GL378046 5228 378047GL378047 5502 378048GL378048 5202 378049GL378049 5152 378050GL378050 5127 378051GL378051 5127 378052GL378052 5108 378053GL378053 5097 378054GL378054 5348 378055GL378055 6372 378056GL378056 5057 378057GL378057 5055 378058GL378058 5045 378059GL378059 5113 378060GL378060 5005 378061GL378061 5094 378062GL378062 5306 378063GL378063 4978 378064GL378064 4956 378065GL378065 4929 378066GL378066 4927 378067GL378067 4894 378068GL378068 4880 378069GL378069 4879 378070GL378070 5197 378071GL378071 4852 378072GL378072 4979 378073GL378073 4830 378074GL378074 4825 378075GL378075 5060 378076GL378076 4798 378077GL378077 4793 378078GL378078 4882 378079GL378079 4774 378080GL378080 4759 378081GL378081 4841 378082GL378082 4709 378083GL378083 4705 378084GL378084 4700 378085GL378085 4680 378086GL378086 4666 378087GL378087 4662 378088GL378088 4662 378089GL378089 5315 378090GL378090 4632 378091GL378091 4622 378092GL378092 4616 378093GL378093 4577 378094GL378094 4576 378095GL378095 4513 378096GL378096 4507 378097GL378097 4505 378098GL378098 4505 378099GL378099 4491 378100GL378100 4483 378101GL378101 4567 378102GL378102 4464 378103GL378103 4461 378104GL378104 4559 378105GL378105 5138 378106GL378106 4449 378107GL378107 5300 378108GL378108 4416 378109GL378109 4416 378110GL378110 4410 378111GL378111 4408 378112GL378112 5129 378113GL378113 4382 378114GL378114 4468 378115GL378115 4357 378116GL378116 4355 378117GL378117 4354 378118GL378118 4352 378119GL378119 5170 378120GL378120 4413 378121GL378121 4303 378122GL378122 4302 378123GL378123 4490 378124GL378124 4276 378125GL378125 4241 378126GL378126 4236 378127GL378127 5043 378128GL378128 4228 378129GL378129 4324 378130GL378130 4218 378131GL378131 4217 378132GL378132 4215 378133GL378133 4201 378134GL378134 4195 378135GL378135 4190 378136GL378136 4290 378137GL378137 4183 378138GL378138 4170 378139GL378139 4168 378140GL378140 4621 378141GL378141 4246 378142GL378142 4552 378143GL378143 4128 378144GL378144 4365 378145GL378145 4417 378146GL378146 4106 378147GL378147 4099 378148GL378148 4289 378149GL378149 4085 378150GL378150 4073 378151GL378151 4057 378152GL378152 4134 378153GL378153 4032 378154GL378154 4015 378155GL378155 4193 378156GL378156 3988 378157GL378157 5252 378158GL378158 4062 378159GL378159 4217 378160GL378160 3955 378161GL378161 4046 378162GL378162 4036 378163GL378163 3926 378164GL378164 3926 378165GL378165 3907 378166GL378166 4186 378167GL378167 3898 378168GL378168 3895 378169GL378169 4242 378170GL378170 4298 378171GL378171 3981 378172GL378172 3970 378173GL378173 3864 378174GL378174 3856 378175GL378175 4042 378176GL378176 3829 378177GL378177 3931 378178GL378178 3997 378179GL378179 3809 378180GL378180 4709 378181GL378181 3798 378182GL378182 3792 378183GL378183 3891 378184GL378184 8241 378185GL378185 3785 378186GL378186 3880 378187GL378187 3773 378188GL378188 3970 378189GL378189 3764 378190GL378190 3913 378191GL378191 3729 378192GL378192 4040 378193GL378193 3823 378194GL378194 3692 378195GL378195 3685 378196GL378196 3684 378197GL378197 3683 378198GL378198 3683 378199GL378199 3921 378200GL378200 3656 378201GL378201 3650 378202GL378202 3746 378203GL378203 3856 378204GL378204 3738 378205GL378205 3621 378206GL378206 3787 378207GL378207 3752 378208GL378208 3595 378209GL378209 3581 378210GL378210 3764 378211GL378211 3642 378212GL378212 3525 378213GL378213 3514 378214GL378214 4107 378215GL378215 3594 378216GL378216 5053 378217GL378217 3752 378218GL378218 3704 378219GL378219 3659 378220GL378220 3828 378221GL378221 3440 378222GL378222 3435 378223GL378223 3632 378224GL378224 4044 378225GL378225 3730 378226GL378226 3393 378227GL378227 3833 378228GL378228 3488 378229GL378229 3727 378230GL378230 4022 378231GL378231 3294 378232GL378232 3594 378233GL378233 3492 378234GL378234 3198 378235GL378235 3187 378236GL378236 3436 378237GL378237 3830 378238GL378238 3702 378239GL378239 3153 378240GL378240 3476 378241GL378241 3582 378242GL378242 3602 378243GL378243 3910 378244GL378244 3344 378245GL378245 3592 378246GL378246 3305 378247GL378247 3488 378248GL378248 3726 378249GL378249 3102 378250GL378250 3559 378251GL378251 3446 378252GL378252 2963 378253GL378253 3302 378254GL378254 3404 378255GL378255 3366 378256GL378256 3630 378257GL378257 3198 378258GL378258 3549 378259GL378259 3450 378260GL378260 3065 378261GL378261 3163 378262GL378262 3459 378263GL378263 3330 378264GL378264 3400 378265GL378265 3193 378266GL378266 3658 378267GL378267 2645 378268GL378268 3136 378269GL378269 3597 378270GL378270 2627 378271GL378271 2819 378272GL378272 3170 378273GL378273 3247 378274GL378274 2386 378275GL378275 2291 378276GL378276 2983 378277GL378277 2254 378278GL378278 3138 378279GL378279 3086 378280GL378280 2909 378281GL378281 2862 378282GL378282 3060 378283GL378283 2048 378284GL378284 2038 378285GL378285 2019 378286GL378286 2843 378287GL378287 2681 378288GL378288 2747 378289GL378289 2401 378290GL378290 1669 378291GL378291 1608 378292GL378292 1592 378293GL378293 1583 378294GL378294 1555 378295GL378295 1534 378296GL378296 1365 378297GL378297 1325 378298GL378298 1290 378299GL378299 1287 378300GL378300 1285 378301GL378301 1264 378302GL378302 3456 378303GL378303 1168 378304GL378304 1137 378305GL378305 1093 378306GL378306 1046 378307GL378307 977 378308GL378308 923 378309GL378309 892 378310GL378310 862 378311GL378311 852 378312GL378312 827 378313GL378313 813 378314GL378314 806 378315GL378315 790 378316GL378316 773 378317GL378317 759 378318GL378318 647 378319GL378319 464 378320GL378320 455 378321GL378321 437 378322GL378322 399

contig

759 sequences